看完了吴汉生送来的情报之后,商毅也只能苦笑无语，看来自已还是太小看东林党，怎么又斗起来了吗。
不过想想也是，因为从东林党诞生的时候开始，就一直没有离开去斗争，在万历时期是和皇帝斗，在天启时期是和宦官斗，到崇祯时期是和温体仁斗，到了南明之后又和马士英斗，反正从来就没有消停过，因此斗争的基因大概也己经深入东林党的骨髄了。
这时商毅也不禁想起自己的本朝太祖的那句名言“与天斗其乐无穷，与地斗其乐无穷，与人斗其乐无穷”，估计东林党也就是这种心态，现在总算是把马士英给斗跨了，东林党也没有可以斗争的对手了，于是那就只好自己人和自己人斗了。
当然商毅马上就明白，在这次斗争的背后，肯定又是有清廷的细作人员在挑动，但这也和东林党一惯的自命清高，眼高手低，不顾大局的总体性格有方。看来南明的这个弱点，己经被清廷牢牢抓住了。
而这次斗争，商毅显然己经无法置身事外了，因为联合李自成抵抗清军，是商毅最先提出来的，并且得到了吴甡的同意之后才得以施行，因此在这个时候，商毅当然也不能袖手不管，任由史可法、吴甡去面对现在的局势。
虽然商毅的原则是尽可能的不参与南京的政治斗争，但有些斗争是怎么躲都躲不掉的，而且照目前的局势发展势头，自己迟早也是要被卷入其中，既然是这样，那么不如自己主动的介入进去，掌握主动权，在任何斗争中都是正确的。
另一方面，商毅如今的身份也不同了，因为江淮战役的获胜，商毅也由一个普通地方军阀一跃而成为拯救了整个江南的抗清名将，同时也掌握着南明最强大的一支军队，那么说话的份量自然也就不同了，无论是谁，在这个时候也不能轻视商毅的意见，而且商毅还掌握着这个时代最大舆论工具，那就是［杭州时报］。现在的［杭州时报］的每期发行量己经达到了万份，其中杭州和南京各有三千份，如此强大的宣传工具，也是商毅最大的优势所在。
商毅立刻招集自己手下的官员开会，研究处理这次的风波。好在是这次顺逆之争目前还仅限于南京地区，并没有波及到浙江来，而在浙江地区内部，对待这件事情的态度基本也是一致的，就是在目前的情况下，联合李自成是绝对应该的。这一方面是因为在江淮战役其间，浙江的官员都深有感触，如果当时没有李自成在武昌挡住清军的西路军，仅仅只靠商家军自己孤军奋战，也无法取得最后的胜利。
李岩在会议上甚致一针见血的指出，为什么在清军进攻武昌的时候，东林党人不闹着要征伐李自成呢，而是等着现在清军撤军了以后，才开始闹起来。
而在另一方面，也是因为一直以来商毅都在自己的内部淡化明朝的概念，而且在商毅手下，没有东林党，或复社的成员，因此对什么给崇祯皇帝报仇之类的事情，根就没有人上心。
因此在会议中众人也都一致决定，在浙江地区内部必须统一口径，并且严加管制，不许出现任何要求征伐李自成的言论出现，更不能因此而发生动乱事件。同时报纸等工具也要加大宣传力度，强调尽量保持和李自成的大顺军联合抵抗清军南侵的重要，而对南京方面，则要慎重一点，最后商毅提议，写一份继续联合李自成的奏折，但措辞语气尽量放缓合一些，而且并不以直接公文的形式送到南京，而是先送给吴甡和史可法，让他们考虑如果适当，在正式送到內阁。
其他人也都认为商毅的办法很不错，这样是最好的处理办法。既表示了对史可法和吴甡的支持，又不显得太过强势，是在威吓南京朝廷，因此也都一致用意。而这份奏折自然是甴王夫之责无旁贷。
而随后商毅考虑的是，下一步的军事安排，从现在的情况来看南明朝廷真的和李自成之间己经形成了裂纹，很难再恢复到以前。而一但双方全面破裂，那么清军肯定不会放过这个机会，一定会从武昌出兵大举南下，而失去了大顺军这一层保护之后，南京的西面防守将会十分空虚，无论是刘良佐还是黄得功，都不可能抵挡得住清军的进攻。在这种情况下，只能有两种选择，一是放弃南京，转向南方内地逃跑，另一种选择是调商毅从浙江出兵，保卫南京。
原来他打算在来年开年的时候出兵进攻徐州，现看起来，这个计划也有可能进行调整了。但如果南京失守，那么浙江就首当其冲，要保卫浙江，直接面对清军的兵锋，如果自己出兵保卫南京，又怎样对付南京复杂的政治局面，同时进取徐州的计划是不是继续执行，这些问题都需要认真考虑，并且早作准备才是。
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商毅的公文发送到南京的时候，在一场东林党内部的斗争巳经全面展开了。事实上在东林和复社的內部构成十分复杂，都是鱼目混珠，稂莠不齐，充斥着大量的投机份子，如果是有共同的敌人，或许大多数人都还能够齐心协力一致对外，一担失去了共同的目标，內乱也不可避免了。
同时江淮战役之后，清军撤军，也减少了对南京的军事压力，因此也有不少人产生了一种错觉，就是现在清廷己没有力量再来进攻江南，而南明偏安一隅的局面也己经基本确定了下来。
这样一来，既没有了共同的敌人，又沒有外来的军事压力，一些人的心里自然也就无所顾忌了，于是都蠢蠢欲动准备为自己争取到最大的权力利益。这也是近百年以来，明朝的文官政治中党争的延续，只不过这一次斗争的不是两个眀显分别的党派，而是来自于同一党团之中，不同派系的斗争。
首先是甴复社的诸人率先发难，继陈贞慧上疏弹亥了内阁之后，四公子也充份表现了他们共进同退做立场，其他三人也不甘示弱，纷纷上书旗帜鲜明的主张与大顺军决裂，出兵征伐李自成。把矛头正接直向内阁。于是在四公子的带领下，倒顺的势力也迅速的扩大了起来，同时在他们的背后，老候恂也在充份利用自己的关系，为他们摇旗呐喊，擂鼓助威。
而在内阁中，与复社关糸密切的黄宗羲也正式改变了立场，完全站到史可法和吴甡的对立面，这时也马上加入了四公子的阵营中，只有钱谦益和姜日广两人还保持着中立的立场。
虽然无论是四公子还是黄宗羲，都不能和史可法、吴甡相匹敌，但他们联起手来却不容小视，一方面在外有复社四公子控制着庞大的基层官员，而在内阁中，又有黄宗羲和他们遥相呼应，可以说是形成了从上至下的全方位进攻，因此一下子就占据了优势。
不过史可法和吴甡自然也不甘示弱，当初淸军南侵时，自己在拼死保卫江淮的时候，你们在那里，现在打退了清军，反到想来摘桃吃，那有那么好的事。怎么也不能让这帮年轻后辈就这么轻易的抢班夺权，而且在江淮战役中，史可法也取得了十分高的人气；早在崇祯时代，吴甡就己经是内阁大学士，也一直都是坚定的支持商毅，因此在他们身边也不乏支持者，尽管在声势上处于下风，但要说败北，还言之尚早。
于是双方纷纷口诛笔伐，大打笔墨官私，你说我忘记君父之仇，我说你不顾当前大局；你骂我不忠不孝，与仇敌勾结，完全是诛心之举，我就骂你不仁不义，要把朝廷至于死地，实在是居心叵测。至于什么君子、小人，天理人欲，道学也都粉墨登场，显得十分热闹。而在明末以来，一直活跃在政坛上的东林党，终于发生了分裂。
不过在这个时候，谁也沒有注意到，挑起这场争斗的始作蛹者，率先去皇宫前哭谏，并且最后还演变成死谏的那一批人，这时早己烟消云散，不知躲到那里去了。皇宫的门口，到是又清静了下来。皇帝朱由崧也是耳不听心不烦，又顾着自己的享乐去了。你们爱怎么闹就怎么闹，反正他不管了。
但就算双方发现了这个现像，也都没有精力去管了，因为现在双方都己经卯上了劲，谁也不能罢手了。
而就在这个时候，商毅的奏折也传到了南京，史可法和吴甡见到之后，也都大喜过望，因为现在他们正处于劣势，身边缺少有份量的帮手，钱谦益、姜曰广、高弘图这些人还保持着中立，因此商毅的这份奏折，洽如雪中送煤一般，毕竟商毅现在在南方的作用可以用举足重轻来形容，有了他的加入，自己这一边必然可以声势大增。
因此就在商毅的奏折送到南京的第二天，吴甡就立刻以商毅的名议，向朝廷公布。